高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展為人類疾病機(jī)制研究、遺傳病診斷、產(chǎn)前篩查與診斷、腫瘤診斷與治療等帶來(lái)了新的應(yīng)用機(jī)遇。全外顯子組測(cè)序，是利用序列捕獲技術(shù)將全基因組外顯子區(qū)域的DNA捕捉并富集后，進(jìn)行高通量測(cè)序的基因組分析方法。

【“小海膽”邀您看高分文章】BD 靶向單細(xì)胞多組學(xué)在低測(cè)序深度下實(shí)現(xiàn)蛋白和低豐度轉(zhuǎn)錄組同時(shí)檢測(cè)

上一回，我們著重講述了為何要進(jìn)行蛋白檢測(cè)。其中幾個(gè)關(guān)鍵參數(shù)大家一定記住了吧！比如在全基因組中，mRNA和蛋白質(zhì)表達(dá)水平之間的相關(guān)性很差，在許多研究中的解釋力（explanatory power）徘徊在40%左右。這一回，我們來(lái)講述如何進(jìn)行蛋白質(zhì)檢測(cè)。

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之前我們略述了代謝組學(xué)的課題設(shè)計(jì)，按照設(shè)計(jì)的思路進(jìn)行實(shí)驗(yàn)后，就需要進(jìn)行代謝樣本的收集了。今天咱按照不同類型的樣本，給大家提供一點(diǎn)收集的建議。

在有限的細(xì)胞核空間中，基因組的大部分是緊密折疊的，僅留下需要轉(zhuǎn)錄的部分是開放的。打開的染色質(zhì)，就允許一些調(diào)控蛋白（比如轉(zhuǎn)錄因子和輔因子）跑過(guò)來(lái)與之相結(jié)合。而染色質(zhì)的這種特性，就叫做染色質(zhì)的可及性（chromatin accessibility）。ATAC-seq是利用高通量測(cè)序檢測(cè)轉(zhuǎn)座酶易接近的染色質(zhì)的技術(shù)。 ATAC-seq只需要很少的細(xì)胞就能鑒定基因組中所有活躍的調(diào)控序列。

DNA甲基化(DNA methylation)是目前研究得清楚、也是重要的表觀遺傳修飾形式，主要是基因組DNA上的胞嘧啶第5位碳原子和甲基間的共價(jià)結(jié)合，胞嘧啶由此被修飾為5甲基胞嘧啶(5-methylcytosine，5mC)。別看這只是一個(gè)小小的改變，它所起到的作用卻是巨大的！有些科學(xué)家甚至將DNA甲基化叫做“第五種堿基”！

伯豪生物目前已經(jīng)先后建成DNA甲基化檢測(cè)芯片/二代測(cè)序平臺(tái)、RNA甲基化分析平臺(tái)，組蛋白修飾分析平臺(tái)、轉(zhuǎn)錄因子分析平臺(tái)和開放染色質(zhì)分析服務(wù)平臺(tái)。2012年至今，伯豪生物表觀產(chǎn)品線已經(jīng)累計(jì)為客戶完成約1000例以上科研服務(wù)項(xiàng)目，涉及組織、細(xì)胞、全血、FFPE等各類實(shí)驗(yàn)樣本約2萬(wàn)例以上，涵蓋腫瘤、胚胎發(fā)育、復(fù)雜疾病等各個(gè)領(lǐng)域，協(xié)助客戶在J Clin Oncol、Nat Commun、PNAS、Ann Rheum Dis等高水平期刊發(fā)表論文30余篇，累計(jì)影響因子150以上（累計(jì)到2020年3月）。下面讓我們一起來(lái)欣賞下部分高分文章吧。

ceRNA（競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA）是近幾年的研究熱點(diǎn)，已知microRNA可以通過(guò)結(jié)合mRNA導(dǎo)致基因沉默，而ceRNA可以通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性地結(jié)合microRNA來(lái)調(diào)節(jié)基因表達(dá)。ceRNA（常見(jiàn)的為lncRNA和circRNA）可以通過(guò)應(yīng)答元件（microRNA response elements, MREs)與microRNA結(jié)合從而影響microRNA導(dǎo)致的基因沉默。