具有完善基因表達(dá)數(shù)據(jù)和表型數(shù)據(jù)的大規(guī)模公共隊列為開發(fā)腫瘤預(yù)后標(biāo)志提供了可能。近年來,機(jī)器學(xué)習(xí)作為人工智能(AI)的分支,已經(jīng)被成功用于建立腫瘤患者預(yù)后和治療預(yù)測的模型。
10x Genomics在分析軟件這一塊還是非常給力的,開發(fā)的每個軟件都非常好用而且操作簡單,特別是安裝方便,基本解壓后就能用。對于10x的空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)主要用10x自己開發(fā)的Space Ranger來進(jìn)行前期的處理。
乳腺癌是發(fā)生在乳腺上皮組織的惡性腫瘤,它是威脅全球女性健康的嚴(yán)重的常見的惡性腫瘤之一,近年來的發(fā)病率與死亡率也逐漸升高。因此,尋找和發(fā)現(xiàn)有價值的乳腺癌生物標(biāo)志物已經(jīng)成為目前研究的一個重要方向。小編這次為大家分享兩篇關(guān)于研究乳腺癌DNA甲基化標(biāo)志物的文章(IF > 10),利用多組學(xué)數(shù)據(jù)分別從兩個方向篩選甲基化標(biāo)志物的研究。
婦科腫瘤是一種多發(fā)病,由于其致病因素較復(fù)雜,癌變組織結(jié)構(gòu)多樣,受神經(jīng)內(nèi)分泌因素影響的不斷變化,所在部位又極易受細(xì)菌或病毒感染,很早就受到人們重視。婦科生殖器腫瘤又以卵巢癌,子宮頸癌,子宮內(nèi)膜癌較為常見,這三種腫瘤并稱為婦科生殖系統(tǒng)三大惡性腫瘤。據(jù)有關(guān)數(shù)據(jù)統(tǒng)計,在我國每年約有1.5萬名女性死于卵巢癌,發(fā)病率雖次于宮頸癌和子宮內(nèi)膜癌,但死亡率卻占婦科惡性腫瘤之首。
單細(xì)胞RNA測序(scRNA-seq)技術(shù)的飛速發(fā)展使人們對組織中細(xì)胞種類、細(xì)胞的特殊狀態(tài)有了深入認(rèn)識。但是,scRNA-seq對于器官或者固體組織制備的細(xì)胞懸液的細(xì)胞活性和細(xì)胞數(shù)目有著較高的要求,這也意味著 “躺在”超低溫冰箱中的大量珍貴臨床樣本(腦組織,腫瘤組織等)都無法進(jìn)行scRNA測序。而單細(xì)胞核RNA測序技術(shù)(snRNA-seq)的出現(xiàn),則在很大程度上解決了以上問題。
7月以DNA methylation為關(guān)鍵詞檢索到的文獻(xiàn)一共有723篇,小編在這里為大家精心挑選了以下7篇作為重點分享,包括胚胎發(fā)育、癌癥、疾病、甲基化標(biāo)志物以及多組學(xué)聯(lián)合分析的研究等。
7月單細(xì)胞測序高分文獻(xiàn)匯總,伯豪生物客戶發(fā)文單細(xì)胞高分文獻(xiàn)匯總。
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序雖好,但是限制也不少于是乎... 追求完美的科研達(dá)人們糾結(jié)ai又犯了...Show Time|單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測序-—乘風(fēng)破浪呼嘯而來。
神經(jīng)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)和功能復(fù)雜?;趩渭?xì)胞技術(shù)對大腦不同組織進(jìn)行解析,可以從細(xì)胞水平上了解神經(jīng)系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)、發(fā)育和發(fā)展過程。
近些年,腫瘤免疫治療發(fā)展火熱,被人們寄予厚望,然而,評價一種療法除了看療效,還要看副作用。以藥物開發(fā)經(jīng)常使用的指標(biāo)IC50(半抑制濃度)為例,人們更希望以很小的劑量就達(dá)到治療的效果,往往大的劑量意味著更多的副作用。
單細(xì)胞項目文章丨單細(xì)胞測序揭示 EGFR 突變肺癌耐藥機(jī)制:線粒體轉(zhuǎn)移搭建腫瘤“保命通道”
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